Σκοπός της απονεύρωσης είναι η αφαίρεση του φλεγμαίνοντος ή νεκρού πολφικού ιστού, ο καθαρισμός και η απολύμανση τόσο της πολφικής κοιλότητας (που βρίσκεται στη μύλη του δοντιού) όσο και των ριζικών σωλήνων (που βρίσκονται μέσα στις ρίζες του δοντιού). Οι καθαροί πλέον και κατάλληλα διαμορφωμένοι ριζικοί σωλήνες εμφράσσονται από τον οδοντίατρο – ενδοδοντολόγο με γουταπέρκα ένα ελαστικό υλικό, που μοιάζει με καουτσούκ. Σκοπός της έμφραξης του ριζικού σωλήνα είναι η αποφυγή επαναμόλυνσης του πολφού.